轻松愉快地安装FFTW在Linux系统上 (fftw linux 安装)

FFTW是一款用于实现快速傅立叶变换的开源软件包,它被广泛应用于信号和图像处理,数值分析以及物理学等领域。在Linux系统上安装FFTW可能会让许多人感到困惑,但事实上只需要几个简单步骤即可完成安装。本文将重点介绍在Linux系统上安装FFTW的方法,帮助大家轻松愉快地享受快速傅立叶变换带来的便捷。

之一步:准备工作

在开始安装前,我们需要确认已安装以下工具:

– 编译器:一般情况下,Linux系统都会默认安装gcc编译器,如果没有安装可以使用以下命令进行安装。

“`bash

sudo apt-get update

sudo apt-get install build-essential

“`

– cmake:cmake是常用的编译工具,负责生成Makefile。使用以下命令进行安装。

“`bash

sudo apt-get install cmake

“`

– Git:如果需要从GitHub上下载FFTW,请使用以下命令进行安装。

“`bash

sudo apt-get install git

“`

第二步:下载FFTW

我们可以通过两种方式获取FFTW,一种是从官方网站下载源码包,另一种是从GitHub上下载源码。

1.从官网下载源码包

打开FFTW官网(http://www.fftw.org/),选择适合自己的版本进行下载。我们以FFTW 3.3.9为例,下载完成后进入下载目录,解压文件。

“`bash

tar -xzvf fftw-3.3.9.tar.gz

“`

2.从GitHub上下载源码

使用Git从GitHub上下载源码包,使用以下命令进行下载。

“`bash

git clone https://github.com/FFTW/fftw3.git

“`

第三步:编译FFTW

进入解压缩目录中新建一个build目录,并在其中进行编译操作。

“`bash

mkdir build

cd build

cmake ..

make

sudo make install

“`

执行make install指令需要管理员权限,如果当前用户权限不够,可以使用sudo以管理员身份执行命令。

这里需要注意的是,在运行cmake之前,可以使用以下命令来查看系统是否支持各种选项。

“`bash

cmake -LH

“`

这个命令列出了所有支持的选项以及它们的默认值。如果需要更改默认值,可以在cmake指令中添加参数来更改。

例如,如果需要将FFTW安装到非默认位置,可以执行以下命令。

“`bash

cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/fftw3 ..

“`

第四步:测试FFTW

测试安装是否成功,可以使用以下命令来验证。

“`bash

make check

“`

该命令运行了一些测试并输出了结果。如果出现任何错误,需要检查安装是否有误,并重复执行前面的步骤。

第五步:使用FFTW

现在,FFTW已经被成功地安装在Linux系统上。它包含许多库和实用程序,可以通过命令行调用进行使用。

在程序中使用FFTW是很容易的,只需要在代码中包含头文件,链接相应的库文件即可。

“`c

#include

int mn()

{

fftw_complex *in, *out;

fftw_plan p;

int N = 512;

in = (fftw_complex*) fftw_malloc(sizeof(fftw_complex) * N);

out = (fftw_complex*) fftw_malloc(sizeof(fftw_complex) * N);

p = fftw_plan_dft_1d(N, in, out, FFTW_FORWARD, FFTW_ESTIMATE);

fftw_execute(p); /* repeat as needed */

fftw_destroy_plan(p);

fftw_free(in); fftw_free(out);

return 0;

}

“`

在上述示例代码中,我们使用了三个FFTW库函数:fftw_malloc,fftw_plan_dft_1d和fftw_execute,它们分别用于内存分配、计算和指定的傅里叶变换。

结论:

相关问题拓展阅读:

  • 为什么编译出的 gromacs 多 GPU 加速效果不好

为什么编译出的 gromacs 多 GPU 加速效果不好

一个可能的原因是 boost 的版本较低。

改进办法是执行如下命令:

# sudo apt-get install libboost-all-dev 

然后按照文章步骤安装就可以了,为了便于阅览,我们把步骤也贴在这里:

机器操作系统为 Ubuntu14.04,安装了 CUDA7.5。

在家目录下建立 gromacs 目录做为工作目录下,搭困拷贝了 4 个

安装包

openmpi-1.6.5.

tar.gz

fftw-3.3.3.tar.gz

cmake-2.8.9.tar

gromacs-5.0.4.tar.gz

1.安装 openmpi

$ cd ~/gromacs

$ tar –xvf openmpi-1.6.5.tar.gz

$ cd openmpi-1.6.5

$ ./configure –prefix=/opt/openmpi

$ sudo make

$ sudo make install

2.安装 fftw 

$ 察枝哗cd ~/gromacs

$ tar –xvf fftw-3.3.3.tar.gz

$ cd fftw-3.3.3

$ ./configure –prefix=/opt/fftw –enable-float –enable-shared

$ sudo make

$ sudo make install

3.安装 cmake

$ cd ~/gromacs

$ tar xvf cmake-2.8.9.tar

$ cd cmake-2.8.9

$ ./bootstrap

$ sudo make

$ sudo make install

4.编译 gromacs GPU 版本

$ cd ~/gromacs

$ mkdir build-gpu

$ cd build-gpu

$ sudo cmake .. -DFFTWF_LIBRARY=/opt/fftw/lib/libfftw3f.so -DFFTWF_INCLUDE_DIR=/opt/fftw/include  -DGMX_MPI=ON –DGMX_GPU=ON -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/gromacs-5.0.4-gpu

$ sudo make

$ sudo make install

步骤 4 编译 gromacs 时,cmake 步骤如果有如下提示信息的话,败行说明 boost 版本低:

配置环境变量:

$ vi ~/.bashrc

增加如下内容:

export PATH=$PATH:/usr/local/cuda/bin

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/cuda/lib64

export PATH=$PATH:/opt/openmpi/bin

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi/lib

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/fftw/lib

export PATH=$PATH:/opt/gromacs-5.0.4-gpu/bin 

保存退出。 

关掉当前终端窗口,重新开启一个终端窗口。 

下面我们测试一下样例程序在单 GPU 和多 GPU 的数据。

测试服务器配置如下:

CPU:2 颗 E5-2620(6 核心)

内存:64G

GPU:2 片 K80(每片 K80 有 2 核心,所以有 4 个 GPU 设备) 

在家目录下建立目录 test,将 ADH_bench_systems.tar.gz 拷贝到该目录下。

$ cd ~/test

$ tar xvf ADH_bench_systems.tar.gz

$ cd adh_cubic

$ grompp_mpi –f rf_verlet.mdp 

单 GPU 的调用命令是: 

$ mdrun_mpi

$ mpirun –np 1 mdrun_mpi

多 GPU 的调用命令是:

$ mpirun –np 2 mdrun_mpi

$ mpirun –np 3 mdrun_mpi

$ mpirun –np 4 mdrun_mpi

单 GPU 设备执行数据如下图:

2 个 GPU 设备执行数据如下图:

3 个 GPU 设备执行数据如下图:

4 个 GPU 设备执行数据如下图:

fftw linux 安装的介绍就聊到这里吧,感谢你花时间阅读本站内容,更多关于fftw linux 安装,轻松愉快地安装FFTW在Linux系统上,为什么编译出的 gromacs 多 GPU 加速效果不好的信息别忘了在本站进行查找喔。

香港服务器首选树叶云,2H2G首月10元开通。
树叶云(shuyeidc.com)提供简单好用,价格厚道的香港/美国云服务器和独立服务器。IDC+ISP+ICP资质。ARIN和APNIC会员。成熟技术团队15年行业经验。

文章来源网络,作者:运维,如若转载,请注明出处:https://shuyeidc.com/wp/205317.html<

(0)
运维的头像运维
上一篇2025-04-07 13:39
下一篇 2025-04-07 13:41

相关推荐

  • 个人主题怎么制作?

    制作个人主题是一个将个人风格、兴趣或专业领域转化为视觉化或结构化内容的过程,无论是用于个人博客、作品集、社交媒体账号还是品牌形象,核心都是围绕“个人特色”展开,以下从定位、内容规划、视觉设计、技术实现四个维度,详细拆解制作个人主题的完整流程,明确主题定位:找到个人特色的核心主题定位是所有工作的起点,需要先回答……

    2025-11-20
    0
  • 社群营销管理关键是什么?

    社群营销的核心在于通过建立有温度、有价值、有归属感的社群,实现用户留存、转化和品牌传播,其管理需贯穿“目标定位-内容运营-用户互动-数据驱动-风险控制”全流程,以下从五个维度展开详细说明:明确社群定位与目标社群管理的首要任务是精准定位,需明确社群的核心价值(如行业交流、产品使用指导、兴趣分享等)、目标用户画像……

    2025-11-20
    0
  • 香港公司网站备案需要什么材料?

    香港公司进行网站备案是一个涉及多部门协调、流程相对严谨的过程,尤其需兼顾中国内地与香港两地的监管要求,由于香港公司注册地与中国内地不同,其网站若主要服务内地用户或使用内地服务器,需根据服务器位置、网站内容性质等,选择对应的备案路径(如工信部ICP备案或公安备案),以下从备案主体资格、流程步骤、材料准备、注意事项……

    2025-11-20
    0
  • 如何企业上云推广

    企业上云已成为数字化转型的核心战略,但推广过程中需结合行业特性、企业痛点与市场需求,构建系统性、多维度的推广体系,以下从市场定位、策略设计、执行落地及效果优化四个维度,详细拆解企业上云推广的实践路径,精准定位:明确目标企业与核心价值企业上云并非“一刀切”的方案,需先锁定目标客户群体,提炼差异化价值主张,客户分层……

    2025-11-20
    0
  • PS设计搜索框的实用技巧有哪些?

    在PS中设计一个美观且功能性的搜索框需要结合创意构思、视觉设计和用户体验考量,以下从设计思路、制作步骤、细节优化及交互预览等方面详细说明,帮助打造符合需求的搜索框,设计前的规划明确使用场景:根据网站或APP的整体风格确定搜索框的调性,例如极简风适合细线条和纯色,科技感适合渐变和发光效果,电商类则可能需要突出搜索……

    2025-11-20
    0

发表回复

您的邮箱地址不会被公开。必填项已用 * 标注