1、基本信息
名称与来源:MIMIC数据库是一个重症医学数据库,全称为Medical Information Mart for Intensive Care,它由贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)、麻省理工学院(MIT)、牛津大学和麻省总医院(MGH)共同建立。
:MIMIC数据库包含2001年6月至2012年10月间在Beth Israel Deaconess Medical Center住院的38,645名成年个体和7,875名新生儿的58,000余次住院资料,这些资料被整理成了26个CSV格式的表格供研究者查询。
隐私保护:为了保护个人隐私,MIMIC数据库中与个人有关的资料都进行了处理,如隐去了患者名字,仅用一个数字表示身份(subject_id),并且时间记录也进行了随机加减。
2、使用权限获取
注册流程:想要获得MIMIC数据库的使用权限,需要先在physionet网站上进行注册,并填写真实信息,之后,还需要参加CITI网站的伦理学考试,并在通过后将证书上传至physionet以获得使用权限。
下载与安装:获得权限后,可以从physionet网站下载所有数据包(约40G),这些数据包都是csv.gz格式,需要在解压后才能使用,本地安装数据库的大致步骤包括下载postgres软件、建库脚本等。
3、数据类型与应用
基础数据类型:MIMIC数据库的数据主要分为两类,一类是从EHR中提取的临床数据,包括患者的人口统计学特征信息、诊断信息、实验室检测信息等;另一类是床旁监护设备采集的波形数据及相关生命体征和事件记录。
应用领域:MIMIC数据库几乎涵盖了所有临床重症患者的数据,包括脓毒症、呼吸衰竭、心梗、心脏术后等多种疾病,它在医学研究和教育领域具有广泛的应用价值,特别是在机器学习、数据挖掘和人工智能等领域。
4、相关注意事项
申请流程:申请使用权限时,需要在physionet网站上完成7个界面的信息填写,并在CITI网站上完成9个模块的考试,整个过程可能需要一周左右的时间才能获得审批结果。
数据安全与合规性:由于MIMIC数据库包含真实的患者数据,因此在使用时需要严格遵守相关的伦理和法律要求,确保数据的合法合规使用。
MIMIC数据库是一个宝贵的医学研究资源,但获取其使用权限需要经过一定的流程和考试,在使用过程中也需要遵守相关的规定和要求。
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